Полезно

Биоинформатика

Наборы данных

Биоинформатика – наука с огромными объёмами открытых данных. Самые популярные биологические базы данных собраны на http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ (ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/).

Более полный список есть на http://sciencehackday.pbworks.com/w/page/24500475/Datasets#Biology+LifeSciences.

APIs

Почти все базы данных обладают API для работы с ними.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/api.shtml
http://www.1000genomes.org/node/517
http://www.ensembl.org/info/data/api.html
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PA...

Инструменты для разработчиков

Помимо открытых данных, почти все инструменты в биоинформатике разработаны в научных группах при университетах. Поэтому они преимущественно бесплатны и с открытым исходным кодом, имеют консольный интерфейс и плохую документацию (иногда никакую).

Для многих языков программирования есть соответствующие библиотеки с базовыми функциями парсинга данных и работы с биологическими базами данных, например https://github.com/biojava/biojava, https://github.com/biopython/biopython, https://github.com/bioperl.

Популярные проекты для анализа геномных данных: https://github.com/lh3/bwa, https://github.com/BenLangmead/bowtie, https://github.com/galaxyproject и другие.

Инструменты для неразработчиков

Биологи используют биоинформатические инструменты каждый день. Это могут быть как консольные инструменты, которые запускаются в основном на сервере, так и визуализаторы данных.

Популярные инструменты: https://ics.hutton.ac.uk/tablet/, http://ugene.net/

Популярные ресурсы, на которых можно найти ответы на вопросы: https://www.biostars.org/, http://seqanswers.com/

Космос

APIs

Астрономия

Astronomy LookUP from Jodrell Bank
flickr.photos.astro — YQL open table returning feeds of coordinates and names for tagged astronomy photos.
starchartjs — Not an API as such. Javascript library for drawing starcharts in <canvas>. Includes bright star catalogue, constellation figures and ephemerides for the planets.
starchartjs (SVG) — Javascript library for drawing star charts with Raphaël. Possibly better cross-browser compatibility than the <canvas> version, but slower. Includes bright star catalogue and constellation figures.
Sloan Digital Sky Survey (SDSS) SkyServer — access spectra and images from the survey.
CDS XML Web Services — convert astronomical coordinates via API.
SETI Institute Data - they've just announced upcoming APIs for some of their data.
NASA Extensions for Google Maps - mostly maps of the Moon and Mars
IFTTT Recipes for Outer Space
WFCAM - access to the UK Infrared Deep Sky Survey (UKIDSS)
Digitized Sky Survey - access the DSS by position on the sky.
SkyMorph/NEAT - Repository of Near Earth Asteroid Tracking CCD images
WorldWide Telescope Script Reference — Javascript API for embedding Microsoft WorldWide Telescope in web pages. Allows you to programme tours of the sky, embed external images, view other planets.
Zooniverse APIs - We are creating APIs in time for this event, such as Galaxy Zoo and Moon Zoo live classification feeds (see http://www.moonzoo.org/live). Feedback/suggestions welcome email robert.simpson@astro.ox.ac.uk.

Наборы данных

Астрономия, Астрофизика и исследования космоса

Данные с телескопов/обсерваторий
- Allen Telescope Array
  - setiQuest project data
- European VLBI Network Archive - radio observations combining data from many telescopes across Europe
  - MERLIN Data Archive (radio) - the catalogue of processed MERLIN data (UK-based radio interferometer) since June 1991
- Fermi Gamma-ray Space Telescope (gamma ray)
- Hubble Legacy Archive (optical) - search utility to find archival Hubble image. Has nice display feature and access to FITS format (raw image data)
- Sloan Digital Sky Survey (optical)
NASA JPL Planetary photojournal
MAST archive (The Multimission Archive at STScI supports a variety of astronomical data archives, with a primary focus on scientifically related data sets in the optical, ultraviolet, and near-infrared parts of the spectrum Gold Parties) http://archive.stsci.edu/missions.html
Экзопланеты
- Exoplanet orbit database - properties of planets orbiting stars other than the Sun. See also the Extrasolar Planets Encyclopaedia and the Visual Exoplanet Catalogue
- http://archive.stsci.edu/kepler/
Пульсары
- The ATNF Pulsar Database (visualization of known pulsars)
Галлактики
- Galaxy Zoo - more than 40 million morphological classifications of 900,000 SDSS galaxies by over 100,000 people.
Space Telescope Science Institute: STScI (http://archive.stsci.edu/)
NASA/IPAC Infrared Data Archive (http://irsa.ipac.caltech.edu/)
Papers data for astronomy and others (ADS: http://adswww.harvard.edu/, arXiv: http://arxiv.org/)
NASA SkyView: multiwavelength, all-sky data server. (http://skyview.gsfc.nasa.gov/)
VizieR: a very complete collection of astronomical databases. http://vizier.u-strasbg.fr/viz-bin/VizieR. For instance get the entire Tycho-II catalog (every star in the sky brighter than 12th mag) or the Hipparcos catalog. (several hundred thousand stars with distances)
Кометы
- 1,300 images of Comet Holmes, with locations on the sky -- see project list for details about this one, or http://www.astro.princeton.edu/~dstn/temp/scihackday/ , you want the files starting with "holmes".
Звезды
- Tycho-2 catalog -- 2.5 million brightest stars -- http://www.astro.princeton.edu/~dstn/temp/scihackday/tycho2-cut.fits
- USNO-B all-sky survey images, NGC/IC galaxy catalogs, constellations, and bright named stars -- in http://astrometry.net/downloads code package: util/ngc2000.py , util/brightstars.c, util/constellations.c, util/usnob_get_images.py or browse at http://trac.astrometry.net/browser/trunk/src/astrometry/util
Аэронавтика
- Discovery in Aeronautics Systems Health (DASHlink) https://c3.nasa.gov/dashlink/resources/?sort=-created&type=28
Gamma-Ray Coordinates Network: http://gcn.gsfc.nasa.gov/
Laser Interferometer Gravitational Wave Observatory (LIGO): https://losc.ligo.org/start/
Space Audio: http://space-audio.org/ - the sounds of space collected by University of Iowa instruments on various spacecrafts

Инструменты для неразработчиков

Идеи для разработки:

Для популяризации:

1. Программа для скачивания снимков по дате и номеру с сайта eol.jsc.nasa.gov.

2. Программа для сборки и разборки GIF-анимаций, с возможностями сохранения оригинальных настроек и изменения размеров, скорости прокрутки, и качества. Функция "Сохранить весом до __ мегабайт".

Для космоса:

1. Программа основанная на принципах распознавания. Задача определения расположения космического аппарата на орбите Луны по наблюдаемым кратерам. Определяется положение над точкой поверхности и высота. На основе серии наблюдей провится траекторные измерения.